Le château de Fléchères, tel qu’il nous apparait aujourd’hui n’a rien de commun avec l’ancienne maison forte qui l‘a précédée. Sa position dominante lui assurait le contrôle de l’axe routier conduisant de Lyon à Dijon, et le passage de la Saône au gué de Grelonges, qui était connu depuis très longtemps, comme un passage important sur la Saône depuis l’époque préhistorique.
Une maison forte du XIIe siècle possédée la Maison des Palatin de Riottiers. Les Palatin prirent leur nom de leur office de châtelain du château de Riottier, custode palatii : Ceux-ci descendaient d’un puînés de la maison de Chabeu comte de Saint-Trivier-en-Dombes.
Hugues Palatin le premier vivait en 1168. La famille palatine, seigneur de Dio, possédait en 1250 la seigneurie de Féchères.
Jean de Villars, chamarier, reçut, tant en son nom qu'au nom du chapitre, l'hommage de Guichard de Marzé, de Flachères ou Fléchères, pour la maison forte de Flachères qu'il avoit acquise des Palatins. Aymon Palatin reconnaît tenir de l’Eglise de Lyon sa maison de Fléchères
Le surnom de Palatin, par succession a été joint à celui de Dio, est le surnom d’Alix Palatin, fille héritière de Guillaume Palatin, seigneur de Fleschin, laquelle (suivant des anciens Mémoires Généalogiques), était femme de Guyot de Dio, Chevalier en 1336 ; et que de ce même Guyot de Dio, est issu Jean de Dio-Palatin, par lequel M. d’Hozier commence la filiation de la famille.
Le château eu à subir les viviscitude de la guerre entre Savoye et Dauphiné. Rompant la trève signée à Macon le 22 novembre 1433, les Dauphinois se jetèrent sur les terres de Fléchères et de Saint-Trivier, faisant de gros dégats
Benoît le Roy, conseiller et receveur général des finances du Lyonnais, acquit, au milieu du xvie siècle, de Claude Montaigny, la seigneurie de Fléchères en Dombes, qu'il revendit, le dernier avril 1561 à Symphorien Thelusson, bourgeois de Lyon, qui échappa aux massacres de la Saint Barthélémy réussissant en se cachant dans un ballot de marchandises, à atteindre Genève.
L'on verra ici dans le registre Genevois l'un des enfants de Symphorien Thelusson, Jean-François Thellusson, seigneur de La Fléchère, qui épousa, en 1598, Marie de-De Tudert.
Cette vente n’eut point d’effet car, n’ayant qu’un fils, d’Anne de Gaspard, sa femme, Louis le Roy fut seigneur de la Fléchères, mais mort sans enfant il fit son héritier Louis de Gaspard, son cousin.
Jean de Dio-Palatin laissa quatre filles, Francoise, Antoinette, Anne et Eleonore de Dio, et un seul garçon, Philibert de Dio, mort chanoine de Saint-Vincent de mâcon. Jacques de DYO-PALATIN ou PALATIN-de-Dio, baron de Fléchères, fit en 1514, une imposition de taille sur les vassaux de la baronnie pour son joyeux événement.
Elle a été acquise le 27 septembre 1606 par Jean de Sève, à qui la Princesse Marie de Bourbon, souveraine de Dombes, donna en 1620, des lettres d ’échange pour les confins de la baronnie de Fléchères.
Le château sera démoli, ne gardant que les bases, et reconstruit de 1606 à 1610 sur les plans d'Androuet du Cerceau par J. Sève., émoin du style Henri lV.